1. 憑證所有人可申請憑證廢止。
2. 依正式公文辦理的司法機關 。

已申辦自然人憑證之用戶，若有下列情形系統將逕行廢止憑證，並寄發憑證廢止通知予憑證用戶：

1. 身分證字號及姓名變更。
2. 死亡
3. 宣告死亡
4. 喪失國籍

※用戶或家屬欲查詢憑證是否為已廢止狀態，可連線至內政部憑證管理中心網站上查詢，網址：http://moica.nat.gov.tw (憑證作業／查詢憑證簽發情形)。

1. 如有更改過憑證資料內容，例：電子郵件信箱、身分證字號及姓名，因為更改憑證資料內容須將原先申請的憑證作廢止，再重新申請一張新的憑證，因此當資料內容變更後會由系統自動寄發一封憑證廢止通知。
2. 用戶欲查詢憑證狀態，可連線至內政部憑證管理中心網站上查詢，網址：http://moica.nat.gov.tw (憑證作業／查詢憑證簽發情形)。