1. 測試級：僅供測試(Test)用，對於傳送的資料不負任何法律責任。
2. 第一級：基本級(Rudimentary)的保證等級，適合應用於惡意竄改之威脅很低的網路環境，或無法提供較高保證等級時，可識別憑證用戶個體名稱及保證被簽署文件的完整性；不適合應用於需要認證的線上交易。
3. 第二級：初級(Basic)的保證等級，適合應用於資訊可能被竄改，但不會有惡意竄改之網路環境(資訊可能被擷取但機率不高)；不適合做為重要文件的簽署。
4. 第三級：中級(Medium)的保證等級，適合應用於有惡意使用者會擷取或竄改資訊、較第二級危險之網路環境，傳送的資料包括金錢上的線上交易。
5. 第四級：高級(High)的保證等級，適合應用於潛在威脅很高、或資訊被竄改後復原的代價很高之網路環境，傳送的資訊包括高金額的線上交易或極機密的文件。

1. 客戶憑證中簽章用的私密金鑰，本憑證管理中心不予以歸檔。
2. 公開金鑰部分，依照憑證管理中心歸檔規範做例行性歸檔，不再另外進行公開金鑰歸檔。

1. 憑證用戶之申請資料，未經憑證用戶本人同意或符合法令規定不得公開或提供第三人使用。
2. 憑證管理中心依照電腦處理個人資料保護法處理憑證用戶之申請資料。

1. 不允許新增、修改或刪除歸檔資料。
2. 將歸檔資料移到另一個儲存媒體，並提供適當的保護，保護等級不低於原保護等級。
3. 將歸檔資料存放於安全場所。

本憑證管理中心主機及內部資料庫連接外部網路會經過雙層防火牆檢核。外部資料庫置於外部防火牆，連接網際網路。提供必要的維護，備援及不中斷的憑證廢止清冊查詢服務。此外，內部資料庫資訊運用數位簽章保護，並自動同步傳送到外部資料庫。外部資料庫採行下列措施

1. 系統修補程式的更新
2. 系統弱點掃描
3. 入侵偵測系統
4. 防火牆與
5. 過濾路由器，防範阻絕服務、入侵等攻擊.

下面為簡易關係圖

1. 憑證管理中心儲存庫公佈之簽發憑證(憑證用戶在申辦程序中同意公佈)、已廢止憑證及憑證廢止清冊不視為機密資訊。
2. 識別資訊或記載於憑證的資訊，除特別約定外，不視為機密資訊。
3. 公佈之資料放於儲存庫供下載查詢，網址：http://moica.nat.gov.tw/(憑證作業／查詢憑證簽發情形)。

1. 託管：私密金鑰不能被托管，且憑證管理中心不替憑證用戶託管私密金鑰。
2. 備份：採行金鑰分持之多人控管方法備份私人金鑰，並使用高安全性之IC卡做為秘密分持的儲存媒體。
3. 停用：憑證管理中心RSA私密金鑰停用，以m-out-of-n控管IC卡組進行控制。
4. 銷毀：憑證管理中心憑證到期(即私密金鑰到期)，在完成金鑰更新和簽發新憑證後。一方面銷毀IC卡內硬體密碼模組的私密金鑰，接著再將實體IC卡銷毀。